Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defb1P56386 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms