Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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