Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PctpP53808 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PctpP53808 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PctpP53808 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms