Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms