Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Apobec1P51908 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Apobec1P51908 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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