Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa8P50706 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms