Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa6P50704 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms