Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
FmodP50608 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
FmodP50608 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
FmodP50608 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms