Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
BckdhaP50136 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms