Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PtpreP49446 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PtpreP49446 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PtpreP49446 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtpreP49446 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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