Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SrprbP47758 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrprbP47758 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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