Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LtbP41155 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LtbP41155 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LtbP41155 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LtbP41155 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LtbP41155 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
LtbP41155 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LtbP41155 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms