Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lig1P37913 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms