Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PpargP37238 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PpargP37238 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PpargP37238 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms