Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddit3P35639 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms