Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc10P31257 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms