Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TbpP29037 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TbpP29037 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TbpP29037 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TbpP29037 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TbpP29037 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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