Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrkcdP28867 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms