Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col2a1P28481 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms