Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Psmb9P28076 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Psmb9P28076 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms