Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb9P20615 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb9P20615 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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