Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PrkcaP20444 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms