Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VimP20152 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VimP20152 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VimP20152 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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