Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rpl13aP19253 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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