Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NefhP19246 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NefhP19246 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NefhP19246 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NefhP19246 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NefhP19246 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NefhP19246 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NefhP19246 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms