Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P18533 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18533 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18533 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms