Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18530 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18530 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18530 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
P18530 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18530 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18530 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18530 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
P18530 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18530 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18530 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18530 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18530 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms