Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18526 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18526 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18526 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18526 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18526 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18526 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18526 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18526 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18526 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms