Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Hoxb1P17919 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxb1P17919 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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