Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CatspereP0DP43 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms