Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Amd1P0DMN7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Amd1P0DMN7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms