Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Surf1P09925 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf1P09925 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Surf1P09925 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms