Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01853 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01853 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01853 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01853 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01853 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01853 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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