Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01641 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01641 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01641 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01641 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01641 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01641 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P01641 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P01641 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms