Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl20O89093 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl20O89093 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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