Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slc6a20bO88575 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slc6a20bO88575 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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