Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AurkcO88445 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms