Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lnx1O70263 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lnx1O70263 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms