Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copb2O55029 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Copb2O55029 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms