Protein–RNA interactions for Protein: O55022

Pgrmc1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, mousemouse

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgrmc1O55022 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pgrmc1O55022 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pgrmc1O55022 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pgrmc1O55022 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pgrmc1O55022 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pgrmc1O55022 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pgrmc1O55022 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pgrmc1O55022 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pgrmc1O55022 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pgrmc1O55022 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms