Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlkO54988 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlkO54988 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlkO54988 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms