Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TsksO54887 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TsksO54887 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TsksO54887 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TsksO54887 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TsksO54887 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TsksO54887 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TsksO54887 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TsksO54887 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TsksO54887 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms