Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjd2O54851 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms