Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DffaO54786 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DffaO54786 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
DffaO54786 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DffaO54786 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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