Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Timm44O35857 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Timm44O35857 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Timm44O35857 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Timm44O35857 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Timm44O35857 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Timm44O35857 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timm44O35857 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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