Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx1aO35526 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx1aO35526 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms