Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TnxbO35452 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms