Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Foxd2O35392 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Foxd2O35392 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms