Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Cnih1O35372 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cnih1O35372 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cnih1O35372 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cnih1O35372 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Cnih1O35372 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih1O35372 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih1O35372 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih1O35372 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih1O35372 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Cnih1O35372 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms