Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ebi3O35228 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms